Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx2P48379 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx2P48379 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms