Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbx2P48031 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms