Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Resp18P47939 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Resp18P47939 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Resp18P47939 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Resp18P47939 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Resp18P47939 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Resp18P47939 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Resp18P47939 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms