Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Igfbp6P47880 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Igfbp6P47880 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Igfbp6P47880 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Igfbp6P47880 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms