Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc2P43407 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc2P43407 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms