Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf6P43028 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf6P43028 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gdf6P43028 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms