Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pik3caP42337 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3caP42337 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3caP42337 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms