Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tac1P41539 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tac1P41539 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tac1P41539 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tac1P41539 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tac1P41539 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tac1P41539 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tac1P41539 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tac1P41539 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tac1P41539 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tac1P41539 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tac1P41539 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tac1P41539 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tac1P41539 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tac1P41539 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tac1P41539 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tac1P41539 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tac1P41539 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tac1P41539 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tac1P41539 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tac1P41539 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tac1P41539 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tac1P41539 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms