Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighmbp2P40694 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighmbp2P40694 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms