Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpargP37238 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpargP37238 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpargP37238 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpargP37238 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpargP37238 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpargP37238 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpargP37238 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpargP37238 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpargP37238 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpargP37238 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpargP37238 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpargP37238 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PpargP37238 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PpargP37238 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpargP37238 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PpargP37238 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PpargP37238 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PpargP37238 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PpargP37238 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpargP37238 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpargP37238 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpargP37238 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpargP37238 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpargP37238 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpargP37238 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpargP37238 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpargP37238 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpargP37238 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpargP37238 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpargP37238 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpargP37238 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PpargP37238 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpargP37238 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpargP37238 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpargP37238 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpargP37238 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpargP37238 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpargP37238 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpargP37238 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpargP37238 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.9 ms