Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sar1aP36536 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1aP36536 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms