Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab17P35292 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab17P35292 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab17P35292 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms