Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3dP35276 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3dP35276 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3dP35276 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms