Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tfap2aP34056 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms