Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pola1P33609 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pola1P33609 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pola1P33609 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pola1P33609 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pola1P33609 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pola1P33609 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pola1P33609 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pola1P33609 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pola1P33609 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms