Protein–RNA interactions for Protein: P31809

Ceacam1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam1P31809 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ceacam1P31809 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ceacam1P31809 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ceacam1P31809 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ceacam1P31809 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ceacam1P31809 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ceacam1P31809 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms