Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa11P31311 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms