Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms