Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fkbp4P30416 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fkbp4P30416 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fkbp4P30416 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fkbp4P30416 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fkbp4P30416 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fkbp4P30416 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fkbp4P30416 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fkbp4P30416 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fkbp4P30416 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms