Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnga1P29974 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnga1P29974 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms