Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OatP29758 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OatP29758 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OatP29758 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OatP29758 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OatP29758 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OatP29758 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OatP29758 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OatP29758 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OatP29758 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OatP29758 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OatP29758 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OatP29758 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OatP29758 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OatP29758 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OatP29758 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OatP29758 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OatP29758 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OatP29758 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OatP29758 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OatP29758 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OatP29758 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OatP29758 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OatP29758 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OatP29758 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OatP29758 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OatP29758 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OatP29758 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OatP29758 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OatP29758 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OatP29758 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OatP29758 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OatP29758 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OatP29758 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OatP29758 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OatP29758 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OatP29758 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OatP29758 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OatP29758 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OatP29758 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OatP29758 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OatP29758 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OatP29758 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OatP29758 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OatP29758 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OatP29758 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OatP29758 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OatP29758 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OatP29758 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OatP29758 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OatP29758 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OatP29758 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OatP29758 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OatP29758 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OatP29758 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OatP29758 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OatP29758 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OatP29758 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms