Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TbpP29037 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TbpP29037 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TbpP29037 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TbpP29037 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TbpP29037 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TbpP29037 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TbpP29037 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TbpP29037 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TbpP29037 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TbpP29037 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TbpP29037 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TbpP29037 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TbpP29037 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TbpP29037 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TbpP29037 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TbpP29037 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TbpP29037 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TbpP29037 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TbpP29037 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TbpP29037 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TbpP29037 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TbpP29037 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TbpP29037 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TbpP29037 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TbpP29037 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TbpP29037 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TbpP29037 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TbpP29037 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TbpP29037 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TbpP29037 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TbpP29037 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TbpP29037 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TbpP29037 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TbpP29037 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TbpP29037 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TbpP29037 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms