Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NapbP28663 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NapbP28663 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NapbP28663 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NapbP28663 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NapbP28663 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NapbP28663 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NapbP28663 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NapbP28663 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NapbP28663 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NapbP28663 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NapbP28663 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NapbP28663 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NapbP28663 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NapbP28663 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NapbP28663 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NapbP28663 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NapbP28663 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NapbP28663 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NapbP28663 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NapbP28663 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NapbP28663 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NapbP28663 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NapbP28663 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NapbP28663 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NapbP28663 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NapbP28663 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NapbP28663 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NapbP28663 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NapbP28663 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NapbP28663 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NapbP28663 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NapbP28663 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NapbP28663 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NapbP28663 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NapbP28663 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NapbP28663 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NapbP28663 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NapbP28663 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NapbP28663 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NapbP28663 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NapbP28663 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NapbP28663 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NapbP28663 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NapbP28663 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NapbP28663 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NapbP28663 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NapbP28663 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NapbP28663 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NapbP28663 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NapbP28663 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NapbP28663 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NapbP28663 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NapbP28663 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NapbP28663 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NapbP28663 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NapbP28663 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NapbP28663 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NapbP28663 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NapbP28663 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NapbP28663 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NapbP28663 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NapbP28663 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NapbP28663 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NapbP28663 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NapbP28663 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NapbP28663 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NapbP28663 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NapbP28663 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NapbP28663 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NapbP28663 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms