Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col2a1P28481 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col2a1P28481 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col2a1P28481 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms