Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LoxP28301 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LoxP28301 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LoxP28301 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LoxP28301 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LoxP28301 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LoxP28301 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LoxP28301 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LoxP28301 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LoxP28301 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LoxP28301 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LoxP28301 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LoxP28301 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LoxP28301 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LoxP28301 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LoxP28301 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LoxP28301 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LoxP28301 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LoxP28301 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LoxP28301 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LoxP28301 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LoxP28301 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LoxP28301 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LoxP28301 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LoxP28301 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LoxP28301 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LoxP28301 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LoxP28301 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LoxP28301 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LoxP28301 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LoxP28301 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms