Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsgP28293 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsgP28293 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsgP28293 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsgP28293 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsgP28293 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms