Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja8P28236 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja8P28236 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja8P28236 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja8P28236 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja8P28236 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja8P28236 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja8P28236 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja8P28236 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja8P28236 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja8P28236 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms