Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpbP27790 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CenpbP27790 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpbP27790 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpbP27790 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpbP27790 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CenpbP27790 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CenpbP27790 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CenpbP27790 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CenpbP27790 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CenpbP27790 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CenpbP27790 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CenpbP27790 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms