Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccnd1P25322 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccnd1P25322 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms