Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a1P24549 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aldh1a1P24549 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a1P24549 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms