Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfyaP23708 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfyaP23708 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfyaP23708 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfyaP23708 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms