Protein–RNA interactions for Protein: P22933

Gabrd, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrdP22933 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabrdP22933 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GabrdP22933 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GabrdP22933 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GabrdP22933 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GabrdP22933 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabrdP22933 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabrdP22933 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms