Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tap1P21958 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tap1P21958 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tap1P21958 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tap1P21958 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms