Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb4P21440 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb4P21440 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb4P21440 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb4P21440 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb4P21440 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb4P21440 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms