Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a2P20490 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a2P20490 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms