Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsp1P19973 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lsp1P19973 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms