Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefhP19246 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefhP19246 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefhP19246 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefhP19246 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefhP19246 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefhP19246 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefhP19246 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefhP19246 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefhP19246 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefhP19246 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefhP19246 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefhP19246 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefhP19246 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefhP19246 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefhP19246 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefhP19246 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefhP19246 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NefhP19246 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefhP19246 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefhP19246 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefhP19246 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefhP19246 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefhP19246 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefhP19246 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefhP19246 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NefhP19246 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefhP19246 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefhP19246 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefhP19246 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NefhP19246 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefhP19246 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefhP19246 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefhP19246 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefhP19246 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefhP19246 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefhP19246 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefhP19246 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefhP19246 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefhP19246 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefhP19246 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefhP19246 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefhP19246 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefhP19246 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefhP19246 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefhP19246 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefhP19246 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefhP19246 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefhP19246 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NefhP19246 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NefhP19246 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefhP19246 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefhP19246 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefhP19246 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefhP19246 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefhP19246 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefhP19246 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefhP19246 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefhP19246 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefhP19246 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NefhP19246 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefhP19246 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefhP19246 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefhP19246 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefhP19246 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefhP19246 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefhP19246 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefhP19246 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefhP19246 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefhP19246 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefhP19246 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms