Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka1P18653 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka1P18653 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms