Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18527 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18527 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18527 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18527 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18527 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18527 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18527 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18527 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18527 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18527 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18527 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18527 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18527 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18527 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18527 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P18527 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18527 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18527 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18527 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18527 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18527 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18527 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18527 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms