Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rag1P15919 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rag1P15919 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rag1P15919 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rag1P15919 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rag1P15919 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rag1P15919 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rag1P15919 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rag1P15919 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rag1P15919 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rag1P15919 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rag1P15919 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rag1P15919 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms