Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms