Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nid1P10493 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nid1P10493 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nid1P10493 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nid1P10493 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nid1P10493 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nid1P10493 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nid1P10493 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms