Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PolP10400 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PolP10400 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PolP10400 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PolP10400 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PolP10400 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PolP10400 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PolP10400 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolP10400 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP10400 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP10400 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP10400 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP10400 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP10400 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP10400 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PolP10400 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP10400 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP10400 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP10400 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP10400 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP10400 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP10400 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP10400 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP10400 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP10400 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP10400 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP10400 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP10400 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP10400 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP10400 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolP10400 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolP10400 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms