Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3cP0DOY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3cP0DOY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms