Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxc9P09633 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxc9P09633 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hoxc9P09633 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc9P09633 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms