Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax1P09084 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax1P09084 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax1P09084 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax1P09084 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax1P09084 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms