Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp1P08042 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms