Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spta1P08032 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spta1P08032 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spta1P08032 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spta1P08032 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spta1P08032 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spta1P08032 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spta1P08032 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spta1P08032 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spta1P08032 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spta1P08032 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spta1P08032 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spta1P08032 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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