Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06334 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06334 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06334 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06334 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06334 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06334 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06334 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06334 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06334 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P06334 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06334 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06334 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06334 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06334 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06334 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06334 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06334 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06334 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06334 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06334 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06334 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06334 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06334 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06334 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06334 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06334 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06334 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06334 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06334 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06334 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06334 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06334 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06334 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06334 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06334 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06334 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06334 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06334 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06334 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06334 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06334 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06334 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06334 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06334 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06334 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06334 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06334 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms