Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P04212 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P04212 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P04212 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P04212 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P04212 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P04212 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P04212 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P04212 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P04212 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P04212 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P04212 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P04212 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P04212 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P04212 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P04212 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04212 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04212 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04212 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04212 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04212 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04212 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04212 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04212 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04212 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04212 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04212 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04212 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04212 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04212 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04212 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04212 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04212 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04212 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04212 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04212 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms